某些吴语中称呼河流的kaon3(音同「港」)的来源是什么？

这个词的来源就是“港/溝”。

以下内容来自李小凡、陈宝贤《从“港”的词义演变和地区分布看古吴语的北界》：

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　　目前所见最早收录“港”字的字书是南朝吴郡人顾野王（519－581）的《玉篇》。《玉篇》“港”字只收一音一义：“古项切，水派也。”此义后世字书皆沿袭。宋初扬州人徐铉（920－991）将“港”收为《说文解字》新附字：“水派也，从水巷声，古项切。”江西南城人陈彭年《宋本广韵》（1008）“港”字两收，一为古项切，义为“水派”；一为胡贡切，构成连绵词“港洞”，义为“开通”。《集韵》（1037）又增收“胡降切，水貌。”《康熙字典》（1716）将以上三个“港”收于同一字头下，将古项切释为“水分流也，一日水中行舟道”。《钦定叶韵汇辑》（1782）“港”除以上三收外，又增加第四收：“鱼亮切，杨万里诗：政缘夜来到渎头，打头风起浪不休。舟人相贺已入港，不怕淮河更风浪。”此处词义应该已经是“港口”，但韵书并未明言。以上情况表明，“港（古项切）”进入字书后一千多年始终只有唯一的“河流”义项。
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　　……“港”的词义发展轨迹：由本义江河的支流扩展外延而用于入海的河口；又由本义改变内涵转用于河湾，继而因河湾可泊船而引伸出港口义，并进一步由河港扩展到海港，以至于今天的航空港。
　　虽然早期字书《尔雅》《释名》《方言》《说文》均未收“港”字，但汉末佛教译经中已有“港”字。例如，三国时旅居东吴的高僧支谦所译《佛说孛经钞》：“见谛沟港。常好布施，赈敷贫穷，人呼为给孤独氏。”“一当念佛……二当念法……三当念众：恭敬亲附依受慧教佛弟子众，有得沟港，受沟港证者；有得频来，受频来证者；有得不还，受不还证者；有得应真，受应真证者。”引文中的“沟港”是表示僧人修行等级的佛教术语，显然是一种引申用法，而“港”的本义当比这更早；引文中“沟港”属同义并用，也显见其水派义。比这更早的“港”字用例是东汉马融（79－116）的《长笛赋》 ：“摩帘巧老，港洞坑谷。”但此例“港”的音义均不同于“港（河流）”，《玉篇》也未收。《广韵》才另收在送韵胡贡切：“港洞，开通。”
　　另有迹象表明，“港”在汉代已用作水名通名。《太平寰宇记•卷126》：“小史港（今合肥小吏港，曾名小市港）即汉建安中庐江府小史焦仲卿妻刘氏为姑所出，自誓不嫁，其家通之，乃投水死，仲卿闻之亦自缢，时人怜之，后为名。”又《中华人民共和国地名词典•湖北省卷》，黄石市黄石港区地名的由来“据《太平寰字记》，东汉末刘助于此筑黄石城，因有港西入华家湖，故名黄石港”。
　　还有一些迹象显示，早在先秦时“港”已用作水名。例如，《中华人民共和国地名词典•江苏省卷》，无锡伯渎港：“相传为商末昊泰伯所开。”（元）刘勋《隐居通义》，江阴申港：“春申乃楚考列王元年为楚相，封为春申君，今浙郡有申港即其地也。”（清）《湖广通志》，钟祥龙凤港：“旧传楚王尝乘彩舫载嫔御游此。”黄冈颜子港：“其左右为长沮桀溺阪石刻‘孔子使子路问津处’八字。”《大清一统志》，当阳昭溪港：“相传楚昭王返国与宫女济此。”（清）《江南通志》，芜湖鸠鹚港：“芜湖古城在芜湖县东三十里，古地，左传襄三年‘楚子重伐吴，克鸠鹚’是也，汉置芜湖县，今县东四十里有鸠鹚港。”据《中华人民共和国地名大词典》，江西上饶市余干县梅港乡：“战国末期梅姓定居江边，因名。”
　　早期字书为何不收“港”字？其原因可能是该字只通行于当时华夏中心区城以外的偏远方域，属方言而非华夏通语。《方言》本该收方言词，但因扬雄只能利用方言区的人进京之机问询，而未能到方言区去作实地调查，故不知该方言词。另一方面，当时“港”可能只是一个口语词，尚无固定字形，故无法收入字书。直到辽代，幽州（北京）僧人释行均 997 年所编《龙龛手镜》仍将“港”和“港”的俗字“⿰氵⿱艹卉”并收：“⿰氵⿱艹卉，俗，音讲，水流也。港，正，同上。”北宋汴京人丁度所编《集韵》则将“溝”视为“港”的异体字：“港、溝，水分流也，或作溝。”陕州人司马光的《类篇》则在收“港”的同时又在“溝”字下另收“港”的音义：“溝，居侯切，《说文》水渎，广四尺深四尺。又古项切，水分流也。”直到金代河北真定人韩道昭的《五音集韵》，仍将“溝”收作“港”的异体字：“港、溝，水也。”值得注意的是，《龙龛手镜》《集韵》《类篇》《五音集韵》的作者释行均、丁度、司马光、韩道昭均为北方黄河流域人，而《玉篇》《广韵》作者顾野王、陈彭年，《说文》新附字收录者徐铉均为南方长江流域人。

稱河爲港在江西一些地方頗爲常見。

《黎川方言詞典》河꜁ho=港꜂kɔŋ（河流，天然的大水道）。港下指河裏，港岸指河岸。

1990年《安義縣志》說全縣水港縱橫密佈，共有50條。縣志列出了這50條小河的名字，全部叫某某港。其中有三條排洪港，估計是上世紀興修水利的產物。

又如1989年《東鄉縣志》記錄的最大的兩條河叫南港、北港，二者匯合之後叫東鄉水，注入撫河。其他較大的水道還有鐵山港、潤溪港（又名大沙港）、小璜港、王橋港（又名花山港）以及瑤河（又名青田港）。剩下更小的水道大多叫某某水。

港、巷估計同源，港即水流經過的通道。