真言宗醍醐派の総本山で、醍醐山全体を寺域とする。山上は「上醍醐」、裾野を「下醍醐」という。下醍醐には国宝の金堂をはじめ、京都最古の木造建築物とされる五重塔など見どころが多い。三宝院の国宝・表書院は寝殿造の様式を取り入れた桃山建築。その前に広がる庭園は豊臣秀吉みずからの設計とされ、国の特別名勝・特別史跡に指定されている。霊宝館には十数万点にもおよぶ寺宝が収蔵・保存され、春と秋にその一部が順次公開される。世界文化遺産登録。