尸魂界から、重禍違反者として、ルキアに捕縛命令が下された。ルキアを捕らえに来たのは、ルキアが“兄様”と呼ぶ、朽木白哉とゴーグルをつけた阿散井恋次という死神。ルキアを助けるため二人と対峙した一護だったが、力の差は歴然で、完敗を喫する。

 こうしてルキアは重罪人として尸魂界に連れさらわれてしまった。ルキアを奪還したいと強く願う一護は、以前からルキアと接触をしていた浦原喜助に修業を懇願し、その一護に呼応したのか、クラスメートである織姫、茶渡、雨竜も加わり、尸魂界へと乗り込む。

 尸魂界へ潜入した一護達であったが、ルキアがいると思われる瀞霊廷に突入する際に、織姫、雨竜、茶渡と離れ離れになってしまう。潜入を手伝ってくれた志波岩鷲とともに、ルキアのもとを目指すが、そこへ立ちはだかるのは護廷十三隊と呼ばれる死神の精鋭が集う部隊だった。

 一方、一護達を旅禍と称し、排除殲滅せんとする護廷十三隊の中でも異変が起きていた。ルキアの処刑に異を唱え、何か裏があると見る者もおり、その中の一人である五番隊隊長・藍染惣右介が殺害されたことによって、自体は混沌を極める。

 ルキアの幼馴染である阿散井恋次を倒した一護は、その恋次からルキア救出を懇願される。一度はルキアとの接触に成功したが、朽木白哉が再び一護の前に立ちはだかる。その戦いは四楓院夜一によって中断され、一護は、己の斬魄刀の卍解を習得するために夜一と修業に入る。

【尸魂界】現世にいる魂魄が送られる場所。死神が住む場所は尸魂界内の瀞霊廷という所
【護廷十三隊】死神の中でも戦闘能力等に秀でた者が集まる組織。其々の隊に隊長、副隊長がいる。
【始解・卍解】斬魄刀との対話・同調により能力を解放する事。卍解は習得に10年以上を必要とする。